Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL35Q6PF15 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms