Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMOD2Q6P5Q4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms