Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMBOX1Q6NT76 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMBOX1Q6NT76 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMBOX1Q6NT76 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMBOX1Q6NT76 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMBOX1Q6NT76 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMBOX1Q6NT76 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMBOX1Q6NT76 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMBOX1Q6NT76 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMBOX1Q6NT76 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMBOX1Q6NT76 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMBOX1Q6NT76 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMBOX1Q6NT76 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMBOX1Q6NT76 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMBOX1Q6NT76 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMBOX1Q6NT76 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMBOX1Q6NT76 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMBOX1Q6NT76 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMBOX1Q6NT76 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMBOX1Q6NT76 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMBOX1Q6NT76 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMBOX1Q6NT76 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMBOX1Q6NT76 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMBOX1Q6NT76 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMBOX1Q6NT76 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMBOX1Q6NT76 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMBOX1Q6NT76 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms