Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARMIL2Q6F5E8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms