Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1QL3Q5VWW1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms