Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP9Q5VTM2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms