Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms