Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGSNQ5TDP6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms