Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms