Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUW0

KRBOX4, KRAB domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX4Q5JUW0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRBOX4Q5JUW0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms