Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
WDR44Q5JSH3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms