Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN2Q52LD8 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms