Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf46Q504U0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf46Q504U0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms