Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SKIDA1Q1XH10 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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