Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IMPG1Q17R60 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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