Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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PTPROQ16827 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PTPROQ16827 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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PTPROQ16827 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPROQ16827 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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