Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ECM1Q16610 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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ECM1Q16610 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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ECM1Q16610 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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ECM1Q16610 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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ECM1Q16610 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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ECM1Q16610 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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ECM1Q16610 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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ECM1Q16610 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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ECM1Q16610 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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ECM1Q16610 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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ECM1Q16610 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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