Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RPE65Q16518 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPE65Q16518 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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