Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms