Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNA2Q15822 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNA2Q15822 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA2Q15822 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA2Q15822 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA2Q15822 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA2Q15822 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA2Q15822 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA2Q15822 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA2Q15822 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA2Q15822 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA2Q15822 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA2Q15822 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA2Q15822 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA2Q15822 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA2Q15822 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA2Q15822 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA2Q15822 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA2Q15822 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA2Q15822 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA2Q15822 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA2Q15822 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA2Q15822 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA2Q15822 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA2Q15822 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA2Q15822 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA2Q15822 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA2Q15822 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA2Q15822 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA2Q15822 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA2Q15822 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA2Q15822 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA2Q15822 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA2Q15822 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA2Q15822 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA2Q15822 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA2Q15822 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA2Q15822 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA2Q15822 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA2Q15822 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
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