Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms