Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIP10Q15642 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms