Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCOLCEQ15113 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCOLCEQ15113 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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