Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3GAP1Q15042 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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