Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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UBE4AQ14139 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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UBE4AQ14139 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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UBE4AQ14139 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE4AQ14139 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
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UBE4AQ14139 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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UBE4AQ14139 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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UBE4AQ14139 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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UBE4AQ14139 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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UBE4AQ14139 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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UBE4AQ14139 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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