Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNC3Q14003 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms