Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GTF2H3Q13889 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms