Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PKP1Q13835 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKP1Q13835 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
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