Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEUROD1Q13562 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms