Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LSAMPQ13449 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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