Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5R2Q13319 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms