Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN3Q13286 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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