Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RIGQ13278 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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RIGQ13278 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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RIGQ13278 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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RIGQ13278 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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RIGQ13278 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RIGQ13278 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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RIGQ13278 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIGQ13278 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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RIGQ13278 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIGQ13278 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIGQ13278 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RIGQ13278 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIGQ13278 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIGQ13278 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIGQ13278 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIGQ13278 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIGQ13278 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIGQ13278 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIGQ13278 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIGQ13278 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIGQ13278 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIGQ13278 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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RIGQ13278 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIGQ13278 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIGQ13278 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIGQ13278 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIGQ13278 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIGQ13278 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIGQ13278 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIGQ13278 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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