Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NME3Q13232 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NME3Q13232 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NME3Q13232 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NME3Q13232 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NME3Q13232 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NME3Q13232 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NME3Q13232 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NME3Q13232 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NME3Q13232 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NME3Q13232 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NME3Q13232 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NME3Q13232 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NME3Q13232 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NME3Q13232 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NME3Q13232 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NME3Q13232 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NME3Q13232 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NME3Q13232 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NME3Q13232 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NME3Q13232 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NME3Q13232 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NME3Q13232 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NME3Q13232 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NME3Q13232 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NME3Q13232 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NME3Q13232 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NME3Q13232 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NME3Q13232 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NME3Q13232 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NME3Q13232 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NME3Q13232 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NME3Q13232 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NME3Q13232 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NME3Q13232 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NME3Q13232 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NME3Q13232 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NME3Q13232 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NME3Q13232 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NME3Q13232 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NME3Q13232 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NME3Q13232 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NME3Q13232 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NME3Q13232 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NME3Q13232 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NME3Q13232 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NME3Q13232 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NME3Q13232 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NME3Q13232 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NME3Q13232 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NME3Q13232 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NME3Q13232 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NME3Q13232 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NME3Q13232 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NME3Q13232 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NME3Q13232 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NME3Q13232 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NME3Q13232 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NME3Q13232 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NME3Q13232 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NME3Q13232 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NME3Q13232 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NME3Q13232 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NME3Q13232 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NME3Q13232 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NME3Q13232 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NME3Q13232 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NME3Q13232 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NME3Q13232 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NME3Q13232 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NME3Q13232 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NME3Q13232 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NME3Q13232 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NME3Q13232 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NME3Q13232 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NME3Q13232 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NME3Q13232 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NME3Q13232 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NME3Q13232 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NME3Q13232 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NME3Q13232 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NME3Q13232 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NME3Q13232 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NME3Q13232 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NME3Q13232 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NME3Q13232 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NME3Q13232 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NME3Q13232 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NME3Q13232 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NME3Q13232 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NME3Q13232 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NME3Q13232 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NME3Q13232 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NME3Q13232 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NME3Q13232 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME3Q13232 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME3Q13232 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME3Q13232 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME3Q13232 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME3Q13232 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms