Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3BQ13214 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SEMA3BQ13214 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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