Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBX3Q13185 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms