Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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