Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXD4Q12950 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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