Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPN13Q12923 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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PTPN13Q12923 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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PTPN13Q12923 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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PTPN13Q12923 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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PTPN13Q12923 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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PTPN13Q12923 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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PTPN13Q12923 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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PTPN13Q12923 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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PTPN13Q12923 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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