Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LMAN2Q12907 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMAN2Q12907 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms