Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TP53BP1Q12888 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms