Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTN1Q12860 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
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