Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC173Q0VFZ6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC173Q0VFZ6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms