Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PDE4BQ07343 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4BQ07343 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms