Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
TNP2Q05952 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 HGNC:18790-207ENST00000505246 973 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AL079304.1-201ENST00000554595 828 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ETFRF1-209ENST00000556885 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 QTRT2-209ENST00000479882 1196 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AC112187.3-201ENST00000607844 408 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms