Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNB3Q05901 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNB3Q05901 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms