Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms