Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms