Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRF8Q02556 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms