Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms